Фамилия Абдулганеев происходит от сложного составного мужского имени Абдулганей, распространённого у тюркских народов, исповедующих ислам. Это имя, в свою очередь, складывается из двух арабских корней. Первый — «Абдул» (вариант «Абдулла»), что означает «раб Аллаха» или «слуга Божий». Второй — «Ганей» (фонетический вариант «Гани»), один из девяноста девяти эпитетов Аллаха, который переводится как «богатый», «состоятельный», а в религиозном контексте — «Всебогатый», «Владеющий несметными сокровищами». Таким образом, полное имя Абдулганей можно истолковать как «раб Всебогатого» или «слуга Бога, обладающего бесконечным богатством».

С точки зрения словообразования, фамилия Абдулганеев — типичная русская патронимическая модель на -ев, которая присоединяется к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или на -й. Суффикс -ев указывает на принадлежность: «Абдулганеев» буквально означает «сын Абдулганея» или «потомок Абдулганея». Фамилия закрепилась в среде татар, башкир и других тюркоязычных народов, которые входили в состав Российской империи и чьи мужские имена адаптировались под русскую паспортную систему в XIX веке.

Интересная деталь, отличающая эту фамилию от многих других арабско-тюркских по происхождению: вторая часть имени («Ганей») нередко встречается в диалектных формах. Например, в татарском языке возможны произносительные варианты «Гани» или «Ганя», что и дало основу для фамильного суффикса -еев, а не более распространённого -ов (который был бы логичен, если бы имя звучало как «Абдулган»). То есть написание «Абдулганеев» зафиксировало именно мягкое окончание исходного имени, что характерно для определённых регионов Поволжья и Приуралья.

Социальный контекст носителей фамилии типичен для мусульманских народов России: это были крестьяне, торговцы, ремесленники, а также представители мусульманского духовенства (муллы, ахунды). В метрических книгах и ревизских сказках XIX века фамилия Абдулганеев встречается преимущественно в Казанской, Оренбургской, Уфимской губерниях, а также среди сибирских татар. Двойное религиозное значение имени (раб + богатый) могло быть осмыслено как пожелание сыну быть верным слугой Аллаха и жить в достатке.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает точнее понять происхождение. Например, фамилия Абдулганиев (с буквой «и» в середине) — более точная арабская транскрипция, а Абдулганеев — результат тюркской огласовки и адаптации к русскому произношению. Также встречается вариант Абдулганин, где суффикс -ин указывает на иную модель образования (от основы на -а). Все эти фамилии восходят к одному корню, но разное написание говорит о региональных и диалектных особенностях записи имени в документах.