Фамилия Абдулганиев происходит от сложного мужского имени Абдулгани. Это имя состоит из двух арабских корней: «Абдул» (от Абдулла, «раб Аллаха») и «Гани» («очень богатый, состоятельный» — один из эпитетов Аллаха). Соединяясь, они дают значение «раб Богатого» или «раб Всебогатого», где под богатством понимается не столько материальный достаток, сколько божественная полнота и щедрость.

В тюркской и мусульманской традиции имена с компонентом «Абдул» (раб) и одним из 99 имён Аллаха — распространённый способ дать ребёнку имя-посвящение. Родители, называя сына Абдулгани, желали ему не просто стать достойным мусульманином, но и получить благословение на благополучную, изобильную жизнь, понимая богатство и как земное благосостояние, и как духовную полноту.

Фамилия образована по русской модели патронимических фамилий: к основе Абдулгани- добавлен суффикс -ев, указывающий на принадлежность («сын Абдулгани»). Такая модель характерна для фамилий многих народов Поволжья, Северного Кавказа и Средней Азии, которые исторически входили в состав Российской империи и восприняли русскую форму оформления родовых имён.

Стоит отметить, что фамилия Абдулганиев — звонкая параллель к более частотной фамилии Абдулганиев (с окончанием -ов), которая встречается у татар, башкир, азербайджанцев и народов Дагестана. Оба варианта восходят к одному имени, а разница в написании — результат адаптации тюркского произношения к русской графике (звук «а» в конце имени мог передаваться как через «а», так и через «я»). Вариант с -ев (а не -ов) указывает на основу, оканчивающуюся на мягкий согласный или «и», что и зафиксировалось в фамилии.