Фамилия Афанасье внешне похожа на русские фамилии с суффиксом -ев, но здесь кроется подвох. В русской традиции форма Афанасье (а не Афанасьев) — это нестандартное окончание, которое выдает нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия, записанная на французский манер: в дореволюционной России выходцы из Франции или обрусевшие дворяне, желавшие придать фамилии европейский лоск, могли отбросить русское -в. В результате Афанасьев превращался в Афанасье, как, например, Бобрищев-Пушкин мог писаться через дефис с французским окончанием. Однако есть и другая версия: фамилия могла возникнуть в среде русских эмигрантов первой волны, когда при оформлении документов во Франции русское -в отсекали по законам французской транскрипции.

Основа фамилии — каноническое мужское имя Афанасий (от греческого «афанатос» — бессмертный). В русской среде имя было чрезвычайно популярно, дав десятки производных форм: Афоня, Фаня, Афанаска. Но в фамилии Афанасье мы видим чистую основу без уменьшительных суффиксов, что указывает на прямое отчество: «сын Афанасия». Если бы фамилия осталась в русской форме, она звучала бы как Афанасьев.

По географии фамилия Афанасье — редкая. Встречается в основном в двух контекстах: у потомков русских эмигрантов во Франции и в странах бывшей Российской империи, где была сильна польская или украинская традиция записи фамилий (там окончание -ев могли заменять на -е). В Польше, например, фамилия Афанасье могла возникнуть как полонизированная форма от русского Афанасьев. В любом случае, носитель фамилии Афанасье почти наверняка имеет предка, который либо жил в иноязычной среде, либо сознательно менял написание фамилии. Сословно это мог быть кто угодно: от крестьянина, чью фамилию исказил писарь, до дворянина, подписывавшего документы на французский манер.