Фамилия Афанасьенко построена по одной из самых узнаваемых моделей восточнославянского фамильного ландшафта — украинской модели на -енко. В основе лежит полное крестильное имя Афанасий, которое пришло на Русь вместе с христианством из греческого языка, где означало «бессмертный». Суффикс -енко в этой системе изначально работал как патронимический маркер: он указывал на родство, буквально «сын Афанасия» или «маленький Афанасий». Таким образом, фамилия Афанасьенко — это не прозвище по занятию или внешности, а прямое указание на отца: предок носителя звался Афанасием.

Массовое закрепление фамилий на -енко приходится на XVI–XVII века на землях Речи Посполитой, которые сегодня входят в состав Украины. Изначально такие формы были временными описаниями младшего родственника, но к XVIII–XIX векам они окончательно перешли в разряд наследственных фамилий. Афанасьенко — типичный продукт этого процесса: фамилия закрепилась за семьёй, где отца звали Афанасием, и её носители, скорее всего, были крестьянами или казаками, а не дворянами, так как шляхта чаще использовала суффиксы -ский/-цкий.

Интересно сравнить Афанасьенко с её русским аналогом — Афанасьевым. Основа одна и та же, но суффикс расставляет географические акценты: -ов/-ев — это северная, великорусская традиция, а -енко — южная, украинская. Именно поэтому Афанасьенко встречается в основном на территории современной Украины, особенно в центральных и восточных областях, а также среди украинской диаспоры. В России эта фамилия редка и почти всегда воспринимается как маркер украинского происхождения.

С однокоренными фамилиями — Афанасьевым, Афанасовым, Афонькиным, Афанасьевичем — их объединяет только имя-основа. Никаких спорных корней или альтернативных объяснений у фамилии Афанасьенко нет: всё прозрачно, без тёмных мест. Это редкий случай, когда этимология не оставляет пространства для догадок — имя отца плюс характерный южнорусский суффикс.