Фамилия Афонасенков — это не просто один из вариантов от имени Афанасий, а редкий пример патронима третьей степени, «внучий» след. В отличие от массовых Афанасьевых, где фамилия образована напрямую от полной формы имени, здесь мы видим цепочку поколений: имя Афонас (просторечная, сокращённая форма Афанасия, греч. «бессмертный») → Афонасёнок (сын Афонаса) → Афонасенков (потомок, внук или правнук того самого сына). Суффикс -ёнок в основе указывает на молодого человека или наследника, а финальное -ов закрепило фамилию за следующим поколением.

Такая модель образования — редкость. Суффикс -ёнок в русских фамилиях характерен для северных и центральных областей, особенно для Смоленщины и Псковщины. В письменных источниках XVII–XVIII веков встречаются крестьяне Афонасенки, чьи дети позже записывались уже как Афонасенковы. Это сразу выдаёт крестьянское происхождение рода: патронимы с суффиксом -ёнок почти не встречались у дворян, предпочитавших формы на -ов/-ев от полных имён.

Основа «Афонас» — не описка, а живое произношение имени Афанасий, которое в народе часто теряло начальный слог и звучало как «Афонасий» или «Афоня». Фамилия сохранила букву «о» в первом слоге, тогда как литературная норма закрепила «а» (Афанасий). Это не случайность, а след акающего говора, который в фамилиях законсервировал старую орфографию и произношение.

В переписях XIX века Афонасенковы встречаются в южных уездах Смоленской губернии и в приграничных районах современной Беларуси. Сравните с однокоренными Афонченковыми или Афонькиными — все они восходят к одному корню, но различаются суффиксами, указывающими на разную степень родства. У Афонасенкова суффикс -енков однозначно говорит о трёх поколениях: дед Афонас, его сын (Афонасёнок) и внук, за которым фамилия закрепилась окончательно.