Фамилия Афонасин — редкий пример того, как живая народная речь перекроила церковное имя под себя. В её основе лежит имя Афонасий — один из просторечных вариантов канонического Афанасий. Греческое «афанатос» означает «бессмертный», но в русских говорах это имя часто упрощали: терялся начальный звук, появлялись формы Офанас, Афонас, Фонас. Именно от формы Афонас и образована фамилия с помощью суффикса -ин.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Афонасин буквально значило «сын Афонаса» или «человек из семьи Афонаса». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Важно, что фамилия сохранила именно народное, «окающее» произношение имени (Афонас), в отличие от книжного Афанасьев, где ударение падает на второй слог и «о» переходит в «а». Так что Афонасин стоит в одном ряду с фамилиями Афонасьев, Афонасов, Фонасов, но отличается от них суффиксом и степенью огласовки.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям, где было распространено «аканье» и где Афанасий часто звучал как Афонасий. Встречается она нечасто — признак локального происхождения, скорее всего, от прозвища или имени конкретного человека в одном или нескольких соседних сёлах. Предок носителя этой фамилии был, вероятно, крестьянином или посадским человеком, которого в документах записали не по церковной, а по обиходной форме имени, как его звали в семье и в округе.

Словообразовательно фамилия интересна тем, что избежала стандартного суффикса -ов/-ев, который чаще присоединялся к именам на твёрдый согласный (Афанас → Афанасов). Выбор суффикса -ин здесь — признак того, что имя Афонас осознавалось как имя с окончанием на -а (как Никита, Фома), что тоже характерно для народной традиции. Это не просто вариация, а свидетельство того, как в конкретной местности имя жило своей жизнью, подчиняясь местным языковым привычкам.