Фамилия Агалакова — женская форма фамилии Агалаков, которая в свою очередь восходит к прозвищу или нецерковному имени Агалак. Чтобы понять её происхождение, нужно разобраться, что значило исходное слово.

Основная и наиболее убедительная версия — тюркская. Имя Агалак происходит от слов «ага» (господин, хозяин, старший) и суффикса принадлежности. Буквально оно переводится как «домашний», «принадлежащий дому», а также «владелец», «хозяин». Такое имя могли дать ребенку в знак уважения к главе семьи или как пожелание стать состоятельным человеком. В тюркской среде имена со значением «господин» или «богач» были распространены как обереги или, наоборот, как характеристика.

Существует и альтернативная, менее распространенная версия, связывающая прозвище Агалак с македонским языком, где оно означало «барство», «самодурство» или «поместье». Если принять эту гипотезу, то прозвище могло указывать либо на владение землей, либо на властный, заносчивый характер человека. Однако тюркская этимология выглядит более правдоподобной, учитывая широкое бытование корня «ага» в фамилиях Поволжья, Приуралья и Сибири.

С точки зрения словообразования, фамилия Агалакова типична для русской ономастики: к основе Агалак добавился стандартный патронимический суффикс -ов, а затем флексия -а, указывающая на женский род. Модель простая: сначала человека называли Агалаком, затем его потомки стали Агалаковыми — то есть «дети Агалака».

Точное место и время возникновения фамилии установить сложно — процесс закрепления фамилий растянулся на несколько столетий. Но можно предположить, что предки Агалаковых жили в регионах активных русско-тюркских контактов, где подобные имена органично входили в обиход и впоследствии закреплялись в документах как фамилии.