Фамилия Аганезов — редкий случай в русском ономастиконе. Её основа — мужское имя Аганес, армянская форма имени Иоанн (Иван), что значит «милость Божья» или «Бог помиловал». В Армении имя Аганес (через вариант Оганес) широко распространено, а в русской традиции оно попало в фамилию через суффикс -ов, который в XIX веке часто добавляли к иноязычным основам при адаптации.

Интересна словообразовательная модель. Классический армянский патроним (фамилия по отцу) выглядел бы как Аганесян или Оганесян. Но в данном случае мы видим русский суффикс принадлежности -ов, который указывает на то, что носитель фамилии или его предки жили в русскоязычной среде — скорее всего, на юге России, в Закавказье или среди казачества, где армянские диаспоры активно смешивались с русским населением. Суффикс -ов здесь работает как типичный «обруситель»: Аганезов — это буквально «сын Аганеса» по русской модели.

Фамилия могла возникнуть не раньше середины XIX века, когда массово закреплялись фамилии у всех сословий, включая мещан и крестьян. В дворянской среде армянские фамилии чаще сохраняли национальный суффикс -ян, поэтому Аганезов — признак более поздней или более простой социальной среды.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где исторически жили армяне: Краснодарский и Ставропольский края, Ростовская область, а также города Закавказья с русским населением. Встречаемость очень низкая — в современных телефонных справочниках России фамилия Аганезов насчитывает буквально единицы носителей.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает понять её уникальность. Аганесян и Оганесян — массовые, Аганезов — штучный вариант, возникший на стыке армянского имени и русской грамматики. Такие гибридные фамилии — живые свидетельства межкультурных контактов, когда человек менял язык, но сохранял память о предке.