Фамилия Аганесов имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркских носителей, а именно выходцев из Золотой Орды: или от печенегов, или от половцев. Соответственно, своими корнями фамилия Аганесов уходит в XV-XVII вв. Сведения в родословной о восточном происхождении фамилии Аганесов являются более или менее точными и подтверждаются соответствующими восточным именем ее родоначальника. Фамилия Аганесов образована от имени Аганес, которое является вариантом армянского мужского имени Оганес, что в переводе на русский язык означает «огненный». Вероятно, нарекая ребенка таким именем, родители желали, чтобы их сын рос энергичным, страстным человеком. Проникновению инонациональных основ в состав русских фамилий, и в частности в состав фамилии Аганесов способствовал тот исторический факт, что многие дворяне в России были по своему происхождению нерусскими. Тем не менее, фамилия Аганесов представляет собой замечательный памятник восточной письменности и культуры.