Фамилия Аганичев — один из самых живых и нешаблонных вариантов в ряду фамилий, образованных от имени Агафон. В её основе лежит каноническое имя, пришедшее из греческого языка и означающее «добрый», «благой». Однако в народной среде длинное имя сократили до формы Аганя, и именно от неё пошла фамилия. Ключевая особенность здесь — суффикс -ичев. В русской ономастике он указывает на патронимическое происхождение и буквально отвечает на вопрос «чей?» — сын Аганича. Сама форма Аганич — это отчество от имени Аганя, построенное по той же модели. Получается двойная патронимическая цепочка: имя Аганя → отчество Аганич → фамилия Аганичев. Такая модель характерна для северных и центральных областей России, где суффикс -ичев был распространён наравне с более привычным -ов (сравните Иванов и Иваничев).

Интересно, что в некоторых говорах «аганя» или «аган» могли называть человека с заметным качеством или внешним признаком, но эта версия менее убедительна. Церковное имя Агафон было настолько популярно в допетровской Руси, что дало жизнь целому кусту фамилий: Агафонов, Агашин, Агафоников, Агапьев. С точки зрения социального состава, Аганичевы — это, скорее всего, потомки крестьян или посадских людей, а не знати. Фамилии на -ичев редко встречались у высшего дворянства, которое предпочитало формы на -ов и -ский. Первые письменные упоминания фамилии встречаются в документах XVI–XVII веков, что говорит о её древности, но без привязки к конкретному роду. Сегодня Аганичевы встречаются по всей России, но заметная концентрация носителей сохраняется в Поволжье и центральных областях — там, где имя Агафон в своё время было особенно любимо.

Если присмотреться к словообразовательной модели, то суффикс -ичев — редкая удача для этимолога. Он встречается реже, чем -ов или -ин, и указывает на формирование фамилии не напрямую от имени, а через промежуточное отчество на -ич. Это делает фамилию Аганичев не просто указанием на отца, а целым микрорассказом о том, как в русской деревне XVI века имя обрастало уменьшительными формами и превращалось в родовое прозвище.