Фамилия Агансонов — редкий случай, когда мы почти наверняка знаем, откуда она пришла, но не до конца понимаем, что означало исходное слово. В ней легко угадывается нерусская основа, а суффикс «-ов» указывает, что фамилию адаптировали по русской модели: на вопрос «чей?» — «сын Агансона». Иными словами, предка звали Агансон, а его потомки стали Агансоновыми.

Самая вероятная версия — фамилия образована от еврейского или немецкого имени Аган (возможно, вариант библейского Аарон или местного Ахаз) с добавлением патронимического суффикса «-сон», что по-скандинавски и по-немецки значит «сын». То есть Агансон — это «сын Агана». Такая модель типична для ашкеназских еврейских фамилий, которые в XIX веке нередко получали «-сон» или «-зон» (ср. Абрамсон, Берсон). В Российской империи, особенно в черте оседлости, их часто русифицировали, добавляя «-ов».

Менее вероятно, но возможно, что фамилия восходит к тюркскому корню. В некоторых тюркских языках «аган» означает «старший брат» или «родственник», и тогда Агансон могло быть прозвищем в смешанной среде, где к тюркской основе приставили скандинавский суффикс — такое встречалось в Поволжье или Приуралье при контактах с крещеными татарами или башкирами. Но эта гипотеза слабее, потому что сочетание тюркского корня с германским суффиксом — редкость, а еврейская модель «имя + сон» — массовое явление.

В любом случае, фамилия Агансонов — искусственная, книжная, не из прозвища или ремесла, а из записи в метрике или переписи. Её носители, скорее всего, происходят из мещан или купцов, живших в западных губерниях или в крупных городах, где оседали еврейские общины. Географически фамилия редкая, встречается точечно, что подтверждает её позднее происхождение — в XIX — начале XX века. Никаких следов древнего боярского рода или казачьей старшины здесь нет.