Фамилия Аганянц — редкий для России случай армянской фамилии, оформленной по русской модели. Её основа — армянское имя или прозвище Аган, которое восходит к тюркскому «аган» (господин, хозяин) или к арабскому «хан» (властитель). В армянской среде это имя могло даваться как уважительное прозвище старшему в роду, богатому человеку или сельскому старосте. Суффикс -янц — это русифицированная версия армянского патронимического суффикса -ян (родовой, сын такого-то). Обычно армянские фамилии в России оканчиваются на -ов или -ев (Аганов), но форма на -янц встречается реже и часто указывает на то, что носители фамилии переселились в Российскую империю в XIX — начале XX века, когда при оформлении документов русские чиновники добавляли окончание -ц по аналогии с польскими или украинскими фамилиями (например, Коваль → Ковальчук → Ковальц). Таким образом, Аганянц дословно означает «из рода Агана» или «потомок Агана». Географически фамилия тяготеет к югу России и Закавказью: её носители встречаются в Краснодарском крае, Ростовской области, Ставрополье, а также в Армении и среди диаспоры. В отличие от более частых армянских фамилий на -ян, вариант с -янц сохранился у тех семей, которые рано обрусели или жили в смешанных регионах, где русская администрация фиксировала фамилии на слух. Сословно предки Аганянц могли быть крестьянами, ремесленниками или мелкими торговцами, но имя Аган в основе намекает на определённый авторитет в общине.