Фамилия Ахматшин — один из тех родовых знаков, который прямо указывает на восточные корни и имя предка-мусульманина. В основе фамилии лежит мужское имя Ахматша — фонетический вариант более полного имени Ахмадиша. Оно составное, и его разбор даёт ключ к пониманию того, какое значение вкладывалось в имя основателя рода.

Первая часть — Ахмади — восходит к арабскому корню со значением «самый знаменитый», «прославленный», «достойный похвалы». Вторая часть — «ша» — это сокращение от персидского «шах», то есть «повелитель», «хан», «правитель». Таким образом, имя Ахматша можно перевести как «самый достойный похвалы повелитель» или «прославленный правитель». В восточной антропонимике компонент «ша» иногда выполнял и уменьшительно-ласкательную функцию, но в данном случае смысловая нагрузка остаётся высокой.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Ахматш- добавлен патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Ахматшин, то есть сын или потомок Ахматши. Такая модель была типична для фамилий, которые возникали в среде крещёных татар и других народов Поволжья, где многие восточные имена адаптировались под русскую грамматику. Если предок носителя фамилии был мусульманином, то фамилия могла закрепиться уже после принятия православия, когда имя Ахматша становилось основой для фамилии, а не личным именем.

Стоит отметить, что фамилия Ахматшин — не единственная в этом ряду. Однокоренные варианты (Ахматов, Ахмадеев, Ахметшин) встречаются гораздо чаще, поэтому именно форма с суффиксом -ин и основой на «ш» может указывать на конкретный регион бытования, чаще всего — на территории бывшего Казанского ханства или Башкортостана. Впрочем, точное время и место возникновения фамилии у конкретной семьи можно установить только через генеалогическое исследование: процесс формирования фамилий у разных сословий растянулся на несколько столетий, и не всегда он был привязан к одной местности.