Основой фамилии Аксиньева послужило церковное имя Авксений. Фамилия Аксиньева восходит к уменьшительно-ласкательной форме крестильного мужского имени Авксентий — Аксиний, которое в переводе с древнегреческого означает «растущий». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Аксиний, со временем получил фамилию Аксиньева.