Фамилия Аксиньины — редкий случай, когда в основе фамилии лежит не каноническое церковное имя, а его народная, разговорная форма. Аксинья — это просторечный вариант имени Ксения, широко распространённый в крестьянской и купеческой среде вплоть до XIX века. В документах того времени можно встретить записи: «крестьянка Аксинья», что указывает на повсеместность этой формы.

С точки зрения словообразования, это матроним — фамилия, образованная от женского имени, что встречается реже, чем патронимы (от имени отца). Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Аксиньин, то есть сын или потомок женщины по имени Аксинья. Такая модель обычно говорит о том, что родоначальником фамилии был человек, чья мать или вдова играла заметную роль в хозяйстве. В условиях, когда мужчина погибал на войне или уходил в рекруты, семья могла писаться по имени матери-вдовы. Поэтому Аксиньины — это потомки той самой Аксиньи, которая, скорее всего, была не просто женщиной, а главой дома в непростые времена.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным областям — Курской, Воронежской, Рязанской губерниям, где имя Аксинья было особенно употребительным. Встречается она и на Дону, у казаков, где женские имена нередко становились основой для прозвищ и фамилий. В старину фамилия могла писаться через «о» — Оксиньины, что отражало диалектное произношение (аканье). В современных справочниках закрепился вариант с «а», но при поиске архивных документов стоит учитывать обе формы.

В отличие от привычных Ивановых или Петровых, Аксиньины не скрывают за сложными суффиксами или заимствованиями простую историю одной женщины, чьё имя передалось потомкам.