Фамилия Алафузова — женская форма фамилии Алафузов, а та, в свою очередь, образована от прозвища Алафуз. Это прозвище звучит не по-русски, и его происхождение почти наверняка связано с тюркскими языками. В татарском и башкирском есть слово «алафуз» или близкие к нему формы, которые означают «неряха», «растрёпа», «неопрятный человек». В некоторых диалектах так могли назвать и просто небрежного, неаккуратного в делах человека. Версия с тюркским корнем — основная и самая правдоподобная, учитывая, что фамилия Алафузов исторически зафиксирована в Поволжье и Приуралье, в зоне активных русско-татарских контактов.

Менее убедительна, но иногда встречается попытка связать основу с арабским «алаф» (корм для скота) или с греческим «алафос» (олень). Эти гипотезы слабые: первая не объясняет суффикс «-уз», вторая — единична и не подкреплена географией фамилии. Поэтому останавливаемся на тюркском «неряхе» — прозвище давалось по внешнему виду или манере поведения.

Суффикс «-ов» в фамилии Алафузов — стандартный русский патронимический показатель, указывающий на принадлежность («чей?» — «Алафузов сын»). То есть предок носителя фамилии был просто Алафузом, а его дети и внуки стали Алафузовыми. Сословная принадлежность могла быть любой: от крестьянина до купца. Известно, что в XIX веке купцы Алафузовы (в частности, Иван Алафузов) действительно существовали в Казанской губернии, что подтверждает тюркскую версию корня — в татарской среде такие прозвища были обычны.

Если сравнивать с однокоренными, то фамилия Алафузов стоит особняком: нет распространённых вариантов вроде Алафузьев или Алафузкин. Редкий суффикс «-уз» в основе сразу выделяет её среди массы фамилий на «-ов» и указывает на то, что прозвище было не от имени, а от конкретного бытового слова. Сейчас фамилия встречается нечасто, в основном в Татарстане, Башкортостане и соседних областях, что полностью согласуется с историей её появления.