Фамилия Алайдарова — женская форма фамилии Алайдаров, и её происхождение напрямую связано с исходной мужской формой. Чтобы понять историю фамилии, нужно разобрать её основу, и здесь ключевой элемент — корень «Алай-». Сразу отметим, что это не русская по происхождению фамилия, а тюркская, и её география бытования указывает на регионы Поволжья, Урала и Западной Сибири, где традиционно проживают татары, башкиры и другие тюркоязычные народы.

В основе фамилии лежит мужское личное имя Алай. Это имя, в свою очередь, может восходить к тюркскому слову «ала» — пёстрый, разноцветный, а также «алай» — войско, полчище (в старотюркском значении). Таким образом, имя Алай могло означать «пёстрый» (как прозвище по внешности) или «воинственный», «относящийся к войску». Вторая версия менее вероятна, но не исключена: имя могло быть вариантом арабского имени Али (высокий, возвышенный) с местным фонетическим изменением, но это спорно, так как «Алай» — самостоятельная и довольно распространённая в прошлом имяформа.

Суффикс «-ар» в составе Алайдаров — это тюркский аффикс, который мог указывать на принадлежность или профессию (например, «алайчы» — воин, участник алая). Однако в данном случае, скорее всего, «Алайдар» — это уже сложившаяся форма имени или прозвища (Алай + ар), где «-ар» — усилительный или именной суффикс. Затем к основе «Алайдар» добавился русский патронимический суффикс «-ов», что является типичной моделью для тюркских фамилий, попавших в русскую документацию. Фамилия Алайдаров буквально означает «потомок (сын) Алайдара».

Сословно предки носителей фамилии, скорее всего, относились к служилым татарам, башкирам или государственным крестьянам. В XVI–XIX веках многие тюркские роды получали фамилии при переписях и рекрутских наборах, и «Алайдаровы» могли быть как рядовыми общинниками, так и представителями мелкой мусульманской знати, если имя Алайдар передавалось в роду несколько поколений. Географически фамилия встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Ударение в фамилии, как правило, падает на второй слог: Алайда́рова.