Фамилия Алефира начинается не с прозвища или ремесла, а с женского имени. Имя это не каноническое церковное, а народная, разговорная переделка греческого. В основе лежит имя Елевферия (мужская форма — Елевферий), которое в переводе с греческого означает «свободная», «независимая». В русских говорах, особенно на юге, где «акали», греческое «Елевферий» превратилось в удобное для произношения «Алефир» или «Олефир». Женская форма этого имени — Алефира — и дала фамилию.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: суффикс -ин указывает на принадлежность. В русской традиции фамилии на -ин чаще всего образовывались от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. Поэтому форма «Алефира» (с окончанием на -а) естественна и буквально означает «дочь или жена Алефиры». Это типичный случай, когда фамилия совпадает с именем матери или жены в родительном падеже (чьих? — Алефиры).

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским областям, где имя Елевферий в быту звучало как Олефир или Алефир. Встречается и родственная фамилия Олефир (без суффикса) — она могла закрепиться как прозвище или усечённая форма имени. Алефира — вариант с суффиксом, типичный для фамилий, фиксирующих отношение к конкретному человеку.

Социальный статус первых носителей, скорее всего, крестьянский или мещанский. Имя Елевферий в святцах есть, но в простонародье оно давалось реже, чем Иван или Пётр. Если человек носил такое имя, это могло указывать на приверженность семьи к редким церковным именам или на то, что имя дали в честь святого Елевферия (его память приходится на 4 августа по старому стилю). Фамилия же закрепилась, когда имя стало передаваться по наследству как родовое прозвание.

В написании фамилии возможны колебания: Алефира и Алефирин. Первый вариант — более старый, когда фамилия совпадает с именем матери или жены в родительном падеже. Второй — более поздняя канцелярская форма с наращением суффикса -ин. В современных документах встречается именно Алефира без дополнительного суффикса, что делает фамилию морфологически прозрачной, но редкой.