Фамилия Алекперова образована от азербайджанской или казахской формы арабского имени Алиакбар, которое восходит к двум основам: Али – «великий» и Акбар - «величайший, самый большой, самый старший». Таким образом, имя Алекпер возможно перевести как «самый старший из великих». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Алекперовых можно лишь на основании генеалогических исследований.