Фамилия Алексанина образована от имени-основы: это производная форма крестильного мужского имени Александр. В переводе с греческого оно означает «защитник людей», но в фамилии важна не столько семантика, сколько словообразовательная модель. Усечённая форма Алексаня — результат народной или семейной переделки имени, характерной для русской бытовой традиции. Суффикс -ин указывает на принадлежность: буквально «чей?» — «Алексанин», то есть потомок или член семьи человека по имени Алексаня. Фамилия Алексанина — женская форма, которая закрепилась за женщиной или вдовой, а исходная мужская — Алексанин.

Эта фамилия встречается реже, чем массовые Александров, Алексанов или Алексахин. Причина в том, что форма Алексаня — не самая распространённая уменьшительная модель; чаще использовали Саша, Шура, Саня. В ономастических трудах Б. Унбегауна такие фамилии на -ин от усечённых имён отнесены к древнему пласту, характерному для северных и центральных областей России. Географически Алексанина чаще фиксируется в Вологодской, Архангельской и Костромской областях, где сохранились архаичные формы имён.

В отличие от фамилий на -ов (Александров), которые могли принадлежать и крестьянам, и дворянам, фамилия на -ин чаще встречалась среди простых людей: крестьян, ремесленников, однодворцев. Это не значит, что носители были незнатны, но указывает на более позднюю фиксацию фамилии в документах — обычно в XVIII–XIX веках. Если искать предков, стоит обратить внимание на переписные книги тех регионов, где форма Алексаня бытовала как обиходное имя.