Фамилия Алексанин образована от производной формы крестильного мужского имени Александр — Алексаня. Имя Александр, одно из самых популярных в христианском мире, в переводе с греческого означает «защитник людей». Потомок человека по имени Алексаня со временем и получил фамилию Алексанин.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Алексанин — буквально «сын Алексан». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от основ, оканчивающихся на -а или -я. В отличие от фамилий на -ов (Александров), форма на -ин встречается реже и чаще привязана к обиходным, уменьшительным вариантам имени.

Сама основа Алексаня — не единственный возможный источник. В говорах существовало и прозвище Алексаня, которое могли дать человеку не по имени, а по характеру или поведению, например, «алексаня» — нечто вроде «важный, представительный». Однако в случае с фамилией Алексанин версия с каноническим именем выглядит убедительнее: слишком массовым было имя Александр в крестьянской среде, чтобы прозвищная гипотеза оказалась основной.

Географически фамилия Алексанин не привязана к одному региону — её носители встречаются и в центральной России, и в Поволжье, и на Урале. Это говорит о том, что имя Алексаня было распространено повсеместно, а не только в какой-то одной местности. В сословном отношении фамилия не аристократическая: как и большинство фамилий на -ин, она типична для крестьян и мещан, получивших родовое прозвание в XVIII–XIX веках.

В ономастических справочниках фамилия Алексанин нередко соседствует с такими же «усечёнными» вариантами, как Алексанкин, Алексанцев, Санин. Все они ведут к одному корню — имени Александр, но через разные уменьшительные формы. Алексанин — один из тех случаев, когда суффикс -ин сохранил прямую связь с личным именем предка, без промежуточных профессиональных или географических наслоений.