Фамилия Альференко построена по типичной украинской модели с суффиксом -енко, который в XVI–XVII веках означал «сын» или «потомок» и был особенно распространён на Левобережной и Слободской Украине, вытеснив более ранние формы на -ович/-евич. Буквальное значение — «сын Альфера» или «маленький Альферец».

Основа фамилии — личное имя Альфер, народная форма крестильного имени Елевферий (от греческого «элеутерос» — «свободный»). В православной традиции это имя давали в честь священномученика Елевферия. Усечение первого слога (Елевферий → Левфер → Альфер) — естественный процесс адаптации длинных греческих имён в живой славянской речи. Встречаются варианты Ольфер, Альферьев, что подтверждает хождение этой формы в разных регионах.

В отличие от фамилий на -енко, образованных от прозвищ или профессий (например, Коваленко — сын кузнеца), Альференко восходит именно к каноническому имени. Это указывает на то, что предок носителя фамилии был крещёным человеком, а прозвищная сторона здесь минимальна. Модель «имя + -енко» типична для казацкой среды и крестьянства, где патроним постепенно закреплялся как наследственная фамилия.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черниговщине, Сумщине, что подтверждается данными переписей XIX века. В России она встречается реже, обычно как результат миграции украинского населения в XIX–XX веках. В документах попадается написание через «о» — Ольференко, что отражает диалектное «аканье» или просто вариативность записи.

Таким образом, Альференко — не случайная фамилия, а указание на предка по имени Альфер (Елевферий), жившего, вероятно, в XVII–XVIII веках. Это типичный украинский патроним, который хранит историю адаптации христианского имени в народной среде.