Фамилия Аференко — один из тех случаев, когда украинская модель фамилии донесла до нас редкое крестильное имя, почти забытое в современном русском языке. В её основе лежит имя Афродисий, которое через народную форму Афрен или Аферен превратилось в фамилию. В переводе с греческого это имя означает «пенорожденная» — постоянный эпитет богини Афродиты. В православных святцах имя Афродисий встречалось, но было редкостью, поэтому и носителей фамилии Аференко немного.

Строение фамилии простое: суффикс -енко — типичный украинский патронимический формант, который буквально означает «сын» или «потомок». Если в русской традиции фамилии на -ов/-ев закрепились в основном за дворянством и крестьянством центральных губерний, то -енко — маркер южнорусских земель, прежде всего территории современной Украины и юга России. Аференко, таким образом, значит «сын Афрена» (или Аференя).

Интересна фонетическая эволюция: от греческого Афродисий до просторечного Афрен — и далее до фамилии. Такое сжатие, или усечение имени, — частый процесс в народной речи: длинное и неудобное имя сокращали до двух-трёх слогов. Поэтому не стоит искать в основе «аферу» или «африканца» — это ложные этимологии. Связь с Афродитой и античной мифологией — единственная достоверная версия.

В дореволюционных переписях и метрических книгах фамилия встречается спорадически, что подтверждает её редкость. Скорее всего, предки Аференко были крестьянами или казаками, жившими в Черниговской, Полтавской или Харьковской губерниях — там, где суффикс -енко был основным способом образования фамилий. Письменные источники фиксируют её с XVIII века, но устная традиция могла быть и старше.

Сегодня Аференко — фамилия, по которой можно судить о миграции: если она встречается за пределами Украины, в Сибири или на Дальнем Востоке, значит, предки переселились в ходе столыпинской аграрной реформы или индустриализации. Искать «родовое гнездо» стоит в архивах южных уездов Российской империи.