Фамилия Альфонцев — редкий случай, когда в основе лежит не славянское имя или прозвище, а западноевропейское. Она образована от крестильного имени Альфонс (восходит к германскому «благородный и готовый к бою»). В русской традиции это имя никогда не было распространённым, поэтому фамилия встречается крайне редко и имеет узколокальный характер.

Суффикс -ев указывает на русскую патронимическую модель: Альфонцев — буквально «сын Альфонца». Форма Альфонец — это обиходный, «обрусевший» вариант имени Альфонс, который мог появиться в среде, где имя звучало часто, но его адаптировали под привычные окончания. Такое переоформление типично для иностранных имён, попавших в крестьянскую или мещанскую среду в XVIII–XIX веках.

Вероятный путь появления фамилии — через дворянство или интеллигенцию. Имя Альфонс в России давали чаще всего в семьях с польскими, французскими или немецкими корнями, а также в среде, ориентированной на западную культуру. Если предок носителя был незнатного происхождения, фамилия могла закрепиться за потомками иностранного специалиста (врача, инженера, гувернёра), который остался в России и чьи дети уже получили русскую фамилию по отцу.

Однокоренных фамилий почти нет. Можно встретить единичные варианты Альфонсов (с суффиксом -ов, от полной формы имени) или польскую форму Альфонский. Но Альфонцев стоит особняком — суффикс -ев при основе на -ец выдаёт именно «народную» адаптацию, а не книжную запись.

Географически фамилия тяготеет к западным губерниям Российской империи и к крупным городам, куда приезжали иностранцы. В современных базах данных носители Альфонцевых встречаются единично, что подтверждает: это не массовая фамилия, а редкий осколок чьей-то семейной истории, связанной с приезжим предком.