Фамилия Алимгузин — наглядный пример того, как тюркское имя обрастает русским патронимическим суффиксом. Её основа — составное мужское имя Алимгуза (Алимгузя), которое складывается из двух частей: «Алим» (от арабского «алим» — знающий, учёный) и «Гуза» (тюркское «гузя» — господин, хозяин, повелитель). В итоге имя целиком переводится как «учёный господин» или «знающий владыка». Подобные двусоставные имена с компонентом «гузя» (в разных диалектах — кузя, кужа, ходжа) были распространены у татар и башкир. Фамилию образовали по стандартной русской модели: к основе Алимгуз- добавили патронимический суффикс -ин, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Алимгузы). Ударение, скорее всего, падает на последний слог: Алимгу́зин.

География фамилии почти целиком связана с Башкортостаном и соседними регионами Урало-Поволжья — Татарстаном, Оренбургской и Челябинской областями. Это типичная башкирская или татарская фамилия, которая закрепилась в русской официальной форме после переписей и введения метрических книг. В дореволюционных записях фамилию могли писать по-разному: Алимгузин, Алимгужин, Алимкузин, а иногда и через дефис, если отец носил двойное имя. Вариант с буквой «ж» (Алимгужин) отражает более мягкое произношение в некоторых говорах, но в современном написании закрепился твёрдый «з».

С точки зрения социальной истории, носители фамилии Алимгузин вряд ли принадлежали к высшей аристократии — суффикс -ин в тюркских фамилиях чаще встречался у крестьян и мещан, в то время как дворяне обычно получали фамилии на -ский или -ов. Однако само имя Алимгуза было почётным: его давали в семьях, где ценили грамотность и уважали религиозное образование. Предки современных Алимгузиных могли быть муллами, учителями при медресе или просто зажиточными крестьянами, знавшими арабскую письменность. Сейчас фамилия остаётся достаточно редкой за пределами Башкирии, что делает её хорошим маркером регионального происхождения.