Фамилия Алимина — женская форма фамилии Алимин, и её происхождение сводится к нескольким версиям, среди которых есть как восточные, так и исконно русские корни. Наиболее убедительная гипотеза связывает фамилию с арабским именем Алим, что значит «мудрый». От него образовали женское имя Алима, а уже от него — фамилию по модели «чей?»: Алимин → Алимина. Такую фамилию могла получить дочь или жена человека по имени Алим или Алима.

Вторая версия отсылает к церковному имени Алимпий (греческое Олимпий, от горы Олимп). В народной речи имя Алимпий часто сокращали до Алим — так же, как Димитрий превращалось в Дим. Если принять эту гипотезу, фамилия Алимина восходит к крестильному имени, а её носители — потомки человека, которого в быту звали Алимом вместо полного Алимпий.

Третья версия — чисто русская, бытовая. В рязанских и владимирских говорах словом «алим» называли простака, простодушного человека. Прозвище Алим могли дать человеку за характер, и оно закрепилось как фамилия. Однако эта версия менее вероятна: прозвища на -а обычно переходили в фамилии с суффиксом -ов (Алимов), а не -ин. Фамилии на -ин чаще образуются от имён и прозвищ на -а, -я, поэтому арабское имя Алима или русское просторечное Алим (от Алимпий) подходят лучше.

Словообразовательная модель проста: основа Алим- + суффикс -ин- (указывающий на принадлежность) + окончание -а. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Али́мина. Фамилия редкая, встречается в основном в центральных областях России и в Поволжье, что косвенно подтверждает и восточное влияние (через татарские или башкирские семьи), и связь с рязанскими говорами. Точное место и время возникновения рода можно установить только через архивные изыскания и генеалогию конкретной семьи.