Фамилия Алисейко говорит о том, что предок носителя носил имя Алисей. Это одна из народных, обиходных форм канонического крестильного имени Алексей, которая закрепилась в белорусской и украинской среде. Имя Алексей пришло из древнегреческого языка, где «алексо» означало «защищать», «отражать», «оберегать» — то есть Алексей буквально понимался как «оберегающий», «защитник». Соответственно, Алисей — это местный, «опрощенный» вариант того же имени, возникший в живой речи.

Суффикс -ко в фамилии Алисейко — типичный для восточнославянских фамилий, особенно распространённый на территории современной Украины и юга Беларуси. В XVI–XVII веках суффикс -ко часто присоединяли к именам и прозвищам, указывая на родство или принадлежность: Алисейко буквально значило «сын Алисея» или «потомок Алисея». Со временем это указание на отца закрепилось как наследственная фамилия.

Интересная деталь: написание через «и» в первом слоге (Алисей, а не Алек-сей) отражает характерную для западнорусских говоров акающую или икающую произносительную норму. Безударное «е» в имени Алексей в белорусском и украинском языках часто переходило в «и»: Аликсей, Алисей. То есть фамилия сохранила живое звучание речи, а не книжную церковнославянскую форму.

Таким образом, носитель фамилии Алисейко — потомок человека, которого в быту звали Алисей, то есть местный вариант имени Алексей. Корень фамилии ясен, суффикс указывает на регион её возникновения, а само имя несёт древний смысл защиты и оберега.