Фамилия Алитратов — редкая и неочевидная для носителя русского языка. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать её не по привычной русской модели «прозвище + суффикс -ов», а обратить внимание на корень. Основа «Алитрат» почти наверняка восходит к арабскому имени или прозвищу, связанному с религиозной сферой. Наиболее вероятная версия — от арабского «аль-Тират» или «Тират», что может означать «чтение» или «рецитация» (в контексте чтения Корана). В тюркских языках, испытавших влияние ислама, это слово могло закрепиться как личное имя или прозвище для человека, известного начитанностью или исполнением религиозных текстов.

Суффикс -ов указывает на русскую адаптацию фамилии, типичную для XVI–XIX веков, когда нерусские имена и прозвища «обрусевали» путём прибавления патронимического суффикса. Таким образом, Алитратов — это буквально «сын Алитрата». Ударение, скорее всего, падает на последний слог: Алитра́тов. Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с греческим словом «алитра» (ἄλιτρα) — «прегрешение», «проступок». Однако в таком случае фамилия была бы скорее семинарской или искусственной, что для редкой фамилии маловероятно: семинаристы обычно брали более «благозвучные» греческие основы.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Поволжью — регионам, где исторически смешивались славянские, тюркские и кавказские народы. Встречается она крайне редко, в основном в единичных записях. Это говорит о том, что родоначальник был, вероятно, выходцем из татарской, башкирской или кавказской среды, принявшим православие или просто получившим русскую фамилию при переписи. Социально предки могли быть муллами, учителями или просто грамотными людьми в сельской общине, так как прозвище связано с книжностью и религиозным знанием. В современном мире носители фамилии, как правило, уже полностью ассимилированы, но сохраняют в фамилии память о далёком предке-чтеце.