Фамилия Альперсон — почти наверняка искусственного происхождения, то есть не сложилась сама собой в крестьянской среде, а была образована по модели, принятой у евреев-ашкеназов в конце XVIII — XIX веках. Ключ к разгадке лежит не в славянском, а в германском и древнееврейском языках.

Основа «Альпер» восходит к слову «alper» — искажённому на идише названию города Альпы (Alp или Alpi) или к имени собственному. Чаще всего её связывают с городом Ален (Aalen) в Вюртемберге, который на идише называли «Альпа» или «Альпен». Вторая часть — «-сон» — типичный немецкий и еврейский патронимический суффикс, означающий «сын». Таким образом, Альперсон — «сын того, кто из Альп» или «сын Альпера» (человека, носившего прозвище по названию города).

В Российской империи такие фамилии на «-сон» были особенно характерны для еврейского населения западных губерний (Беларусь, Украина, Литва) и Прибалтики. Их часто давали при переписях или добровольно выбирали при получении паспортов. Альперсоны — это не потомки одного родоначальника, а множество независимых семей, взятых от разных местных «Альперов» или просто по моде на немецкоязычные патронимы.

Среди носителей фамилии встречались раввины, купцы и врачи — в основном интеллигенция и торговцы. В современном Израиле фамилия нередко менялась на «Альпери» или «Бен-Альпер» в рамках гебраизации.

Если отбросить версию с городом, есть и более редкий вариант: от еврейского имени «Альпер» — ашкеназской формы библейского имени «Эльазар» (Бог помог). Но в таком случае логичнее было бы ожидать фамилию «Эльперсон» или «Элиазаров». Связь с немецким топонимом выглядит убедительнее.