Фамилия Алутин — из числа тех, что произошли от уменьшительной формы крестильного имени. В основе лежит имя Алексей (в переводе с греческого — «помощник», «заступник»), а точнее, его народная, обиходная форма — Алюта или Алута. Чередование гласных «ю» и «у» в данном случае — результат живых фонетических процессов, которые происходили в русских говорах: так имя Алексей в разных местностях звучало и как Алёша, и как Алёха, и как Алюта, и, наконец, как Алута.

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: к основе Алут- добавили суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — «сын Алуты»). Это типичный способ для русских фамилий, возникших от имён, оканчивающихся на -а или -я (сравните: Ильин, Никитин, Фомин). По этой же схеме могли появиться фамилии и от других уменьшительных форм имени Алексей, например, Алёшин или Алёхин.

Говорить о точном времени и месте возникновения фамилии Алутин сложно: процесс формирования родовых имён на Руси был долгим и неравномерным. Крестьяне центральных губерний массово обзаводились фамилиями лишь к концу XIX века, после отмены крепостного права. Однако сама модель — отчество на -ин от прозвищной формы — встречается в письменных источниках уже с XV–XVI веков. Так что предки современных Алутиных могли носить это родовое прозвание несколько столетий.

Интересно, что фамилия Алутин встречается не повсеместно, а тяготеет к определённым регионам. По данным современных телефонных справочников и баз адресов, заметное число носителей живёт на юге России и в Поволжье — в Волгоградской, Ростовской областях, а также в Краснодарском крае. Это может указывать на то, что фамилия закрепилась в среде однодворцев или государственных крестьян, которые переселялись на южные рубежи в XVII–XVIII веках.