Фамилия Амирханяна — армянская по происхождению, и её разумнее всего рассматривать в контексте армянской ономастики, а не русской. В русской среде она появилась как результат русификации и, скорее всего, принадлежит семье, которая давно живёт в России или происходит из смешанного брака. Но основа фамилии — чисто армянская.

Разберём эту основу. Фамилию образовали от мужского имени Амирхан, которое составное. Первая часть — «Амир» (арабское «повелитель, князь»), вторая — «хан» (тюркский титул, также означающий правителя). Имя Амирхан — двойной титул, что-то вроде «князь-хан». В армянской среде такие имена были распространены в эпохи, когда регион находился под влиянием арабских халифатов и тюркских династий (Сельджуки, османы, персы). Имя давали не обязательно знатному роду — часто это было пожелание ребёнку стать уважаемым человеком.

Ключевая особенность — армянский фамильный суффикс -ян (в старой орфографии -янц), который означает «принадлежащий к роду» или «потомок». То есть Амирханян — это «из рода Амирхана». Если бы фамилию оформляли по русской модели, она звучала бы как Амирханов. Но армянская модель сохранила свою грамматику: в русском языке мы склоняем её по второму склонению (кого? — Амирханяна, кому? — Амирханяну). Форма «Амирханяна» — это не искажение, а нормальная адаптация: родительный падеж от армянской фамилии, закреплённый в документах. В бытовом общении её часто сокращают до Амирханян, но официально может быть закреплена именно форма с окончанием -а, что типично для русифицированных армянских фамилий в России.

Географически фамилия Амирханян наиболее характерна для западных регионов исторической Армении (сейчас восток Турции) и для тех мест, где армянское население долго соседствовало с арабо-тюркским миром — например, районы Вана, Муша, а также Нагорный Карабах. Внутри Армении она встречается, но не так массово, как, скажем, фамилии на -ян от чисто армянских имён (Петросян, Геворкян). Социальный контекст прост: предки носителя фамилии — не обязательно аристократы, а люди, получившие имя, которое в тех краях звучало весомо и статусно.