Фамилия Анилина — женская форма, а её мужской вариант — Анилин. В основе фамилии, скорее всего, лежит не химическое вещество (анилин), а русское нецерковное имя или прозвище Анила. В старых русских говорах «анила» означало «обманщица», «льстивая женщина», но также могло быть производной формой от крестильного имени Анила (женский вариант имени Анилий, восходящего к латинскому Anilius — «слуга» или к греческому «анемос» — «ветер»). В любом случае, прозвище или имя Анила давалось человеку с определённым складом характера — хитроватому, изворотливому или, наоборот, ласковому и угодливому.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Анилин сын, Анилина дочь. Это типичная модель для русских фамилий, образованных от имён или прозвищ, оканчивающихся на -а. Если бы основа кончалась на твёрдый согласный, был бы суффикс -ов, но здесь именно -ин, что подтверждает женскую основу — Анила.

Интересная деталь: фамилия Анилин встречается редко, и её носители могли происходить из центральных или южнорусских областей, где были распространены уменьшительные формы имён на -ила (например, Данила, Анила). В дореволюционных переписях эта фамилия почти не фиксируется, что говорит о её позднем закреплении или локальном бытовании. В некоторых случаях фамилия могла возникнуть и от отчества, образованного от имени Анилий (церковная форма, редкая в народе), но это менее вероятно — в крестьянской среде чаще брали обиходный вариант.

Сравните с однокоренными фамилиями: Анилов, Анильев, Анильский. Анилин стоит особняком — он указывает на конкретное лицо женского пола в основе, что необычно для русских фамилий, где чаще берут мужское имя. Возможно, фамилию дали по матери или вдове, которая вела хозяйство. Такое случалось, но редко, и делает Анилина не просто вариантом, а самостоятельным ономастическим курьёзом.