Фамилия Анойко — редкий пример, где географическая привязка важнее морфологии. Она почти наверняка украинская или белорусская, и ключ к её пониманию — суффикс -ко. Этот суффикс — характерный маркер западно- и южнорусских земель (современные Украина и Беларусь). В XVI–XVIII веках он активно участвовал в образовании фамилий от прозвищ, имён и названий профессий. «Анойко» указывает на то, что перед нами потомок человека, которого звали Аной.

Что такое «Аной»? Это народная, разговорная форма церковного имени Анофрий (каноническая форма — Онуфрий). В русском и украинском языках имя Онуфрий давало множество производных: Онуфрей, Ануфрий, Ануфрей, а в просторечии — Аной, Аноха, Ануха. Фамилия Анойко, таким образом, означает «сын Аноя» или «маленький Аной», то есть потомок человека, носившего это имя. Имя Онуфрий в православных святцах встречается нередко, поэтому версия с церковным именем — самая надёжная.

Вторая, менее распространённая версия, связывает фамилию с диалектным словом «аной», которое в некоторых говорах означало «тихий, смирный» или, наоборот, «простак, недотёпа». Если прозвище Аной дали по характеру, то фамилия Анойко — «потомок Простака». Однако имя Онуфрий встречалось гораздо чаще, поэтому первая версия надёжнее. В ономастических словарях (например, у Б. Унбегауна) модели на -ко от имён рассматриваются как типичные для украинской патронимии, а диалектные прозвища — как вторичный источник.

Фамилия очень редкая. Встречается на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в приграничных районах Беларуси. В России её носители — почти наверняка потомки переселенцев с запада времён Столыпинской аграрной реформы или более поздних миграций. Словообразовательная модель проста: основа Аной- + патронимический суффикс -к- + окончание -о. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Анойко́. Встречаются варианты написания с одной «н» — Анойко, и это нормально для фамилий, возникших в устной традиции до введения строгих правил орфографии. По сути, Анойко — это «сын Онуфрия», только в народном, сокращённом варианте.