Фамилия Анпилогогв — один из тех редких случаев, когда написание почти полностью скрывает происхождение. На первый взгляд кажется, что перед нами что-то греческое или искусственное. На деле это искажённая запись от имени Анфилоген или Анпилоген.

В основе лежит греческое имя Ἀνφιλογένης (Анфилоген) — сложное слово, где первая часть восходит к «анфи» (вокруг, с обеих сторон), а вторая — к «генос» (род, происхождение). Примерный смысл — «двуродный» или «окружённый роднёй». Имя попало в русские святцы через православие, но встречалось редко, поэтому в быту его переделывали на слух: «Анпилоген», «Анпилогой». От последнего варианта и пошла фамилия.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования: «чей?» — Анпилогогов, то есть потомок человека по прозвищу Анпилогой. Форма с двумя «г» подряд (Анпилогогв) — результат упрощения на письме или ошибки переписчика: в исходном варианте Анпилогогов последовательно сохранялся корень «-лог-» и суффикс «-ов», но в некоторых документах фамилию записывали без одной буквы, и со временем вариант без «о» мог закрепиться.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским губерниям, особенно к бывшей Екатеринославской и Харьковской. Там греческие имена через церковные записи чаще попадали в крестьянскую и казачью среду, а затем искажались до неузнаваемости. Носители Анпилогогв — скорее всего, потомки крестьян или однодворцев, получивших фамилию по крестильному имени предка, которое никто уже не помнил правильно.

Редкость фамилии объясняется и редкостью исходного имени, и его фонетической неудобностью для русского уха. В отличие от фамилий вроде Анпилогов (от Анпилог), форма с двойным «г» и без второй «о» — почти уникальный артефакт канцелярской ошибки, застывшей в паспорте.