Фамилия Антипаев принадлежит к распространённому типу русских фамилий, образованных от полной формы крестильного имени. В основе лежит каноническое имя Антипа (церковная форма — Антипа, от греческого «антипаос» — «противник» или, по другой версии, «упрямый»). В святцах известен священномученик Антипа Пергамский, поэтому имя было в ходу на Руси, хоть и не так часто, как Иван или Пётр.

Модель образования простая и типичная для XIX века: к основе имени Антип (в разговорной речи «а» перешло в «и», и форма Антип закрепилась) добавили патронимический суффикс -ев. Суффикс -ев, а не -ов, появился потому, что основа заканчивается на мягкий согласный «п». Так Антип + ев дало фамилию, буквально означающую «сын Антипа». В быту крестьянина или мещанина Антипаев — это ответ на вопрос «чей будешь?».

Интересная деталь: в некоторых регионах (особенно на Русском Севере и в Поволжье) имя Антип могло звучать как Онфим или Антипка, но фамилия Антипаев фиксируется в документах именно в такой форме. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне Антипаевы в Вятской и Пермской губерниях — это указывает на географию распространения: северо-восток европейской России. Южнее, в чернозёмных губерниях, фамилия встречается реже, там чаще бытовала форма Антипов.

Сословно фамилия недворянская: Антипаевы в основном были государственными крестьянами, реже — однодворцами. В списках купечества или духовенства эта фамилия почти не попадается, что подтверждает её народное, «мужицкое» происхождение. Сейчас носители фамилии живут по всей России, но наибольшая концентрация сохраняется в Кировской области и Удмуртии.