Фамилия Антипановы образована от старинной народной формы крестильного имени Антипан. Это разговорный вариант церковного имени Антипа, которое носил один из первых христианских святых. В переводе с греческого имя Антипа (Antipas) означает «противник всего» или «упрямый».

Священномученик Антипа был учеником апостола Иоанна Богослова и епископом Пергамской церкви. В годы правления императора Нерона, когда христиан преследовали за отказ приносить жертвы идолам, святой Антипа своей проповедью отвратил от язычества многих жителей Пергама. Разгневанные жрецы требовали от него прекратить проповедь, но епископ ответил отказом. За непокорность его подвергли жестокой казни. После смерти гробница святого стала местом чудес и исцелений — к ней приходили больные с разными недугами.

Фамилия строится по типичной русской модели: к основе Антипан- добавляется суффикс -ов, указывающий на принадлежность. Буквально Антипановы — это «дети Антипана». Такая модель образования фамилий была особенно распространена в XVI–XVII веках среди крестьян и посадских людей. Сейчас сложно сказать, где именно впервые появилась эта фамилия, но процесс её закрепления шёл постепенно: сначала отчество Антипанов закреплялось за главой семьи, а затем передавалось детям как наследственное имя.

Интересно, что в русских говорах имя Антип и его производная форма Антипан встречались достаточно часто, поэтому фамилия Антипанов относится к числу редких, но не уникальных. В отличие от более распространённой фамилии Антипов, форма с суффиксом -анов встречается реже.