Фамилия Антонайтус — яркий пример литовской фамилии, которую носитель, оказавшись в русскоязычной среде, не стал переделывать на «русский лад», а оставил в исходной форме. Это сразу указывает на её балтийское происхождение, причем не просто литовское, а с характерным суффиксом, который в Литве встречается часто, а за её пределами — редкость.

Корень здесь очевиден: крестильное имя Антон, которое в Литве и Польше издавна бытовало в форме Antanas. От него и пошла фамилия. Ключевая деталь — суффикс -айтус (лит. -aitis в мужском роде). В литовской традиции этот суффикс выполнял роль отчества или фамильного показателя: он указывал на сына или потомка. То есть Антонайтус — это буквально «сын Антанаса» или «потомок Антона». В Литве фамилии на -aitis (в русской записи часто -айтис или -айтус) были распространены в основном среди крестьян, особенно в жемайтских говорах, и зачастую передавались по мужской линии без изменения.

Интересна и финальная часть: окончание -ус (а не -ис). В литовском языке мужские фамилии в именительном падеже обычно заканчиваются на -as, -is или -us. Форма Antanaitus (с -us) — это диалектный или исторический вариант, который в современной Литве мог бы выглядеть как Antanaitis. Такое написание на русский манер («Антонайтус» вместо «Антонайтис») — результат записи фамилии по слуху, без литовской грамматики, что часто случалось в метриках Российской империи.

Таким образом, предок человека с такой фамилией — скорее всего, литовский крестьянин из западной части Литвы (Жемайтия), чьего отца звали Антанасом. Фамилия не несет в себе указания на ремесло или прозвище: она чисто патронимическая, то есть «по отцу». В русской среде она осталась редкой и легко узнаваемой, поскольку не вписалась в привычную модель с суффиксами -ов или -ин.