Фамилия Апалуп — одна из тех редких русских фамилий, чья основа не укладывается в привычные схемы. В ней нет ни суффикса -ов/-ев, ни -ин, которые обычно оформляют фамилии от крестильных имён или профессий. Перед нами «чистая» прозвищная фамилия, застывшая в форме, близкой к исходному прозвищу. Такое оформление — само по себе подсказка: оно чаще встречается на западе славянского мира, в украинской и белорусской традиции, где фамилии нередко обходятся без дополнительных суффиксов (сравните Коваль, Голуб, Козуб).

Ключ к значению, скорее всего, лежит в диалектной лексике. Наиболее убедительная версия связывает корень «апал» с глаголом «опалять» (обжигать) или существительным «опал» (ожог, а также опавшая листва). В южнорусских и украинских говорах слово «апал» означало «пал», «пожог» — выжженное место в лесу или степи, которое использовали под пашню. Прозвище Апалуп мог получить человек, живший на таком месте или занимавшийся подсечным земледелием. Сложнее с частью «-уп». Этот суффикс в русских фамилиях редок, но в украинской и белорусской ономастике он встречается (Ковальчук, Голуб) и мог играть роль уменьшительного или пренебрежительного форманта. Не исключено, однако, что «-уп» не суффикс, а часть корня, и прозвище изначально было цельным словом, смысл которого сегодня утерян.

Вторая версия — тюркская, от «апа» (старшая сестра, мать) и «луп» (корень, основание) — выглядит искусственной и не подтверждается надёжными лингвистическими параллелями. Её стоит отбросить.

Географически фамилия Апалуп тяготеет к западным регионам России, Украине и Беларуси. Встречается она крайне редко, что указывает на локальное происхождение: скорее всего, прозвище одного человека в конкретной местности со временем закрепилось за его потомками. Сословного статуса предков по фамилии не определить: прозвище могло перейти и к крестьянину, и к казаку, и к мещанину.