Фамилия Апалайко звучит необычно для русского уха, и это прямой ключ к её происхождению. Её выдает суффикс -айко, который нехарактерен для великорусских фамилий, но типичен для украинской и белорусской ономастики. В этих языках суффикс -айко часто образует фамилии от личных имен или прозвищ, придавая им уменьшительно-ласкательный или шутливый оттенок. Сравните с фамилиями Палайко, Грицайко, Макайко — все они построены по одной модели.

Основа фамилии — Апалай. Это, скорее всего, народная форма крестильного имени Аполлинарий (в просторечии — Аполлон). В украинской традиции имя Аполлон могло трансформироваться в Апалай через замену звуков и усечение. Менее вероятна версия от имени Павел (украинское Павло) или от глагола «палати» (гореть, пылать) — прозвище Апалай в значении «вспыльчивый человек» тоже возможно, но имя остается более надежной основой.

Конечное -ко в фамилии Апалайко — это не уменьшительный суффикс, а показатель принадлежности. Первоначально Апалайко означало «чей?» — «Апалаев», «потомок Апалая». Такая модель словообразования широко распространена на западнорусских землях: фамилии на -айко (и их варианты на -енко) прямо указывают на сына или слугу человека, носившего соответствующее прозвище или имя.

В письменных источниках фамилия встречается редко, что подтверждает её локальное происхождение. Географически она тяготеет к западным областям Украины и, возможно, к югу Беларуси. В современных базах данных носители фамилии Апалайко фиксируются преимущественно в Украине, что окончательно снимает вопрос о её «великорусском» следе. Это не случайная запись в метрике, а маркер конкретной региональной традиции именования.