Фамилия Аптина — редкий случай, когда женская форма закрепилась в качестве основной. Перед нами не «Аптин» с наращённым -а, а именно Аптина, и это сразу задаёт направление поиска. Скорее всего, фамилия образована от мужского прозвища или имени Аптя (или Оптя) с помощью притяжательного суффикса -ин: чей? — Аптин, в женском роде — Аптина. В русской традиции фамилии на -ин обычно принадлежали потомкам человека, которого звали Аптя, и первоначально звучали как «Аптина жена» или «Аптина дочь», а позже закрепились за всей семьёй.

Корень «Апт-» неочевиден. Самая вероятная версия — диалектное или просторечное произношение имени Апти, которое восходит к греческому Авксентий (от «ауксо» — расту, увеличиваю). В народной речи имя могло сократиться до Аптя, а суффикс -ин добавил фамильную форму. Менее распространённая гипотеза связывает основу с тюркским «апты» (старший, почтенный) — такое прозвище могли дать уважаемому человеку в смешанных русско-татарских семьях Поволжья. Третья, самая слабая версия — от слова «опт» (торговля оптом), но для прозвища это маловероятно: фамилии от названий торговых операций крайне редки и обычно имеют суффикс -ов.

Географически фамилия Аптина встречается точечно, без ярко выраженного гнезда. Несколько семей с такой фамилией зафиксированы в Тверской, Московской и Рязанской областях, а также среди старообрядцев — они часто сохраняли архаичные формы имён и прозвищ. В дореволюционных метрических книгах Аптины изредка попадаются среди крестьян и мещан центральной России.

Словообразовательная модель проста: основа Апт- + суффикс -ин. Это типичный патроним (отчество в роли фамилии), но в женском роде. Если бы фамилия была Аптин, она бы не вызывала вопросов — обычная мужская форма. А вот Аптина как постоянная фамилия для всех членов рода — признак того, что в какой-то момент женская форма стала родовой, либо перед нами случай, когда фамилию дали по матери или вдове (например, «Аптина вдова»). В ономастике это редкое, но не уникальное явление.

Однокоренные фамилии — Аптин, Аптев, Оптин (от того же Апти/Оптя). Фамилия Оптина известна шире благодаря Оптиной пустыни, но её происхождение другое: от названия местности или речки Опта. Аптина и Оптина — разные корни, путать их не стоит.