Фамилия Аптукова хранит память о своём восточном корне. В её основе лежит тюркское имя Аптук — диалектная, упрощённая форма более полного имени Габдетукай или Гаптукай. Это имя составное, и его разбор позволяет понять, как мог выглядеть мир предков человека по имени Аптук. Первая часть «габде» восходит к арабскому корню со значением «раб Аллаха», что указывает на религиозный контекст и распространённость таких имён в среде мусульманского населения. Вторая часть, «тукай», имеет иное происхождение: в монгольских языках этим словом обозначали излучину реки, пойму или низину, поросшую кустарником. Соединяя обе основы, получаем значение «раб Аллаха, родившийся у излучины реки» или, в более широком смысле, «раб Аллаха, появившийся на свет в заросшей кустарником пойме».

Имя Габдетукай, давшее начало фамилии, — характерный пример сращения арабской религиозной лексики с местными тюркскими или монгольскими географическими терминами. Такие имена нередко давали, чтобы отразить место рождения ребёнка или особенности ландшафта вокруг дома. Со временем полное имя в бытовом общении сократилось до формы Аптук (как, например, Гаптук), и именно это сокращение легло в основу фамилии. Модель образования проста: к основе Аптук добавился русский патронимический суффикс -ов, означающий принадлежность («чей?» — сын Аптука). Так потомки человека по имени Аптук, или Габдетукай, стали Аптуковыми. Фамилия фиксирует не только имя предка, но и возможную географическую привязку его семьи к речной долине или заросшей низине, что делает её ценным источником для реконструкции семейной истории.