Фамилия Арапидис — почти стопроцентный маркер греческого происхождения. Её выдает конечный элемент -идис (или -иди в более кратком варианте). В греческой ономастике этот суффикс означает «сын» или «потомок», то есть Арапидис — это «сын Арапа». Функционально он соответствует русским фамилиям на -ов или -ин.

Основа фамилии — Арап. В русском языке слово «арап» исторически означало человека с очень темной кожей, африканца или негра, и пришло через польское или турецкое посредничество из арабского. Однако в греческой среде у этого прозвища мог быть иной оттенок. В греческом диалекте «арапис» (αράπης) могло означать не столько этническую принадлежность, сколько смуглого, черноволосого или загорелого человека. Греки, жившие в Причерноморье или на юге России, часто получали такие прозвища за внешность — густые черные волосы и смуглую кожу, которые выделяли их среди более светловолосого славянского населения.

Таким образом, родоначальник фамилии Арапидис, скорее всего, не имел отношения к Африке. Он был греком, которого за характерную южную внешность прозвали «арапом». Его потомки, переходя на фамилию по греческой модели, стали Арапидисами. Географически фамилия тяготеет к регионам, где были компактные греческие общины: юг Украины (Одесса, Мариуполь), Крым, Приазовье, а также территории современной Греции и Турции (до обмена населением 1923 года).

Интересная деталь: в русском языке фамилия сохранила ударение на последнем слоге — Арапи́дис, что характерно для греческих фамилий. Если бы фамилия русифицировалась, ударение могло бы сместиться, но этого не произошло. Встречаются также варианты написания через «о» — Орaпидис, что связано с аканьем в южнорусских говорах, где безударное «а» произносится как «о».