Фамилия Аратамонов — один из примеров того, как церковное имя в народной речи обрастает новыми звуками. В её основе лежит имя Аратамон, которое возникло как просторечная форма крестильного имени Артемон. Имя Артемон, в свою очередь, восходит к древнегреческому слову со значением «невредимый», «здоровый», «безупречный». В православных святцах почитается несколько святых с этим именем: святитель Артемон, епископ Селевкийский (память 6 апреля), священномученик Артемон, пресвитер Лаодикийский (26 апреля), и мученик Артемон (22 ноября).

Интересна история появления буквы «а» в начале фамилии. Сначала имя Артемон в разговорной речи упростили до Артамон — выпал один звук. А затем, для удобства произношения, между двумя согласными «р» и «т» «вклинился» дополнительный гласный «а». В лингвистике такое явление, когда в слове появляется лишний звук, называется эпентезой. Так имя превратилось в Аратамон, а потомок человека с таким именем получил фамилию Аратамонов.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность: «сын Аратамона» или «из рода Аратамона». Это типичная патронимическая фамилия, то есть происходящая от личного имени отца. Встречается она довольно редко и в основном на юге России, в частности на Дону и Кубани, где были сильны традиции народного произношения церковных имен.