Фамилия Ардынцева — женская форма, исходная мужская — Ардынцев. В её основе лежит прозвище или имя Ардынец, а корень «ардын-» отсылает к тюркскому слову «ардын» (задний, тыловой) или к монгольскому «ард» (народ, люди). В русской ономастике такая модель — суффикс -ец, указывающий на принадлежность к чему-то или происхождение откуда-то. Ардынцем могли назвать человека, который жил на задворках села, в отдалённой части поселения, или же того, кто был выходцем из народа, простолюдином. В тюркских языках «арды» также могло означать «позади», что даёт версию о географическом прозвище: «тот, кто сзади» — например, живший за рекой или за лесом.

Словообразовательная модель проста: основа «Ардын-» + суффикс -ец (указывает на лицо, носителя признака) + фамильный суффикс -ев. Фамилии на -ев типичны для русских фамилий, образованных от прозвищ на -ец, -як, -ик. В данном случае патронимическая форма от прозвища Ардынец: «сын Ардынца». Встречается в основном в центральных и южных регионах России, где было сильное тюркское влияние, особенно в Поволжье и на Урале. Редкая фамилия, не имеющая массового распространения, что говорит о локальном происхождении — скорее всего, от одного прозвища, закрепившегося в конкретной семье или небольшой местности.

Альтернативная версия, менее вероятная, связывает корень с «ардын» как искажённым «ордын» — от слова «орда». Тогда Ардынец мог означать «человек из Орды», то есть выходец из Золотой Орды или её осколков. Но в русских говорах «ардын» не зафиксировано как форма «ордын», а в тюркских «ардын» — самостоятельное слово, так что версия с «задним» или «народным» прозвищем правдоподобнее. Фамилия не связана с каким-то ремеслом или сословием — скорее, это прозвищное имя, данное по местоположению или социальному положению.

Встречается вариант написания с одной «н» — Ардыцева, но это результат опечаток или местных говоров, где «н» выпадало при произношении. В целом, Ардынцева — фамилия с тюркским следом, которая говорит о том, что предки носителя жили на окраине или были простыми людьми, не из знати.