Фамилия Архипушкин образована от народной, ласкательной формы имени Архипп — Архипушка. Само имя Архипп имеет греческие корни и переводится как «повелитель лошадей», «главный всадник» или «начальник конницы». В Древней Греции такое имя мог получить человек, связанный с уходом за лошадьми или командованием конным отрядом, но в русской традиции оно быстро утратило эту профессиональную окраску и стало обычным крестильным именем.

Фамилия построена по типичной для русских фамилий модели: к основе Архипушк- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Буквально Архипушкин означает «чей?» — сын Архипушки, потомок человека по имени Архипушка. Такая форма с суффиксом -ин характерна для фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я (Архипушка → Архипушкин).

Интересно, что в официальных документах имя Архипп встречается редко, а его уменьшительные варианты — Архипка, Архипушка — были в ходу в крестьянской и мещанской среде. Это значит, что фамилия Архипушкин, скорее всего, возникла в простонародной среде, где ласкательные формы имён нередко закреплялись в качестве родового прозвания. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые могли даваться по полному имени отца, фамилии на -ин часто фиксировали именно обиходное, домашнее имя.

По своему происхождению Архипушкин — типичная «отчество в третьем поколении»: сначала человека звали просто Архипушка, его детей — Архипушкины (то есть «дети Архипушки»), а затем это прозвание закрепилось за внуками и правнуками как фамилия. Такая модель широко распространена в русской ономастике, особенно в северных и центральных губерниях. В словарях Б. Унбегауна и В. Никонова подобные фамилии описываются как характерный пример народной адаптации церковных имён.