Фамилия Арсеев образована от канонического мужского личного имени Арсений, а точнее от его производной формы — Арсей. Имя Арсений в переводе с греческого языка означает «мужественный». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Арсей, со временем получил фамилию Арсеев.