Фамилия Арсене — редкий случай, когда перед нами, скорее всего, не исконно русская, а латышская или румынская фамилия, записанная кириллицей. В русской ономастике фамилии с таким окончанием (-ене, -уне, -ане) почти не встречаются: наша традиция требует суффикса принадлежности (-ов, -ин, -ский). Поэтому, если вы встретили «Арсене» в российском контексте, это либо результат полонизации, либо, что вероятнее, латышская фамилия, попавшая в документы во времена Российской империи.

Разберёмся с моделью. В латышском языке фамилии с окончанием -е (в мужском роде) — обычное дело, а не исключение. Основа здесь та же, что и в греческом имени Арсений (от «арсен» — «мужественный»). Латышская фамилия Арсене образована от личного имени Арсений или его уменьшительной формы Арсен по простой схеме: имя + суффикс -е (как Ozols — Ozoliņš, но здесь окончание короче). По-латышски это звучало бы как Arsenе и означало бы «сын (или потомок) Арсена». В Латвии фамилия встречается, но не входит в сотню самых частых — это скорее редкая, локальная фамилия.

Есть и другая, менее вероятная версия: румынская фамилия Арсене (Arsene) — тоже от имени Арсений, но с другим суффиксом. В румынском это скорее вариант фамилии Арсенеску, где -е — окончание мужского рода. В Молдове и Румынии такая фамилия встречается, но там чаще пишут Arsene, без кириллического окончания.

Что касается сословного происхождения, то в Прибалтике фамилии в массовом порядке закреплялись за крестьянами в XIX веке. Носитель фамилии Арсене — скорее всего, потомок латышского крестьянина или батрака, получившего фамилию по имени отца при переписи. Священников или дворян с такой фамилией в русских губерниях не зафиксировано — это подчёркивает её «низовое» происхождение.

Главная практическая польза для ищущего: если ваши предки — из Латвии или западных губерний (Курляндской, Лифляндской), то фамилия объясняется просто. Если же предки из центральной России — это почти наверняка искажение исходной фамилии (например, Арсеньев) при переписи или в эмиграции. В любом случае, корень один — древнегреческое «арсен» (мужской, мужественный), а не какая-то экзотическая основа.