Фамилия Артугановы образована от прозвища или личного имени Артуган. Его основное значение, скорее всего, восходит к тюркскому слову artuq (или artyq) — «выдающийся среди других, сильный, лучший, высший». Такое имя могли дать человеку, который выделялся способностями, или как пожелательное имя, чтобы ребенок вырос лучшим.

Существует и вторая, обрядовая версия. То же тюркское слово «артук» («артык») означает еще и «лишний». В этом случае имя Артуган могли дать долгожданному ребенку в семье, где дети умирали или долго не рождались: считалось, что «лишнее» имя обманет злых духов и убережет младенца. Оба варианта укладываются в тюркскую ономастику и выглядят правдоподобнее, чем версия с монетой.

Тем не менее, в русских говорах слово «артуга» действительно существовало. Так называли монету «артиг», которую с XIV века чеканили в Швеции при короле Магнусе II. Через Новгород и Псков эти монеты попали на Русь, где их называли артугами, и они некоторое время заменяли древние куны. Если прозвище Артуган произошло от этой монеты, то его мог получить зажиточный или прижимистый человек, но эта версия менее вероятна: суффикс -ан скорее характерен для тюркских имен, чем для прозвищ от русских названий монет.

Исторические документы подтверждают бытование этой основы: в 1573 году в Новгороде упоминается стрелецкая голова Артыков Сулеш Семенович. Это указывает на то, что имя Артуган (в форме Артык) было в ходу среди служилых людей на северо-западе Руси, где тюркские влияния смешивались с местными традициями. Фамилия Артуганов закрепилась по стандартной модели: к основе Артуган добавили русский патронимический суффикс -ов, означающий «сын Артугана». Со временем форма множественного числа (Артугановы) стала обозначать весь род.