Фамилия Айдарбаева — женская форма фамилии Айдарбаев, которая имеет отчетливое тюркское происхождение. Её основа — составное мужское имя Айдарбай, распространенное у многих тюркоязычных народов: казахов, башкир, татар, киргизов, узбеков. Первая часть имени, «Айдар», восходит к тюркскому слову со значениями «чуб», «вихор», «прядь волос» (иногда — «петушиный гребень»). В традиционной культуре айдаром называли специально оставленную прядь волос на выбритой голове мальчика — знак мужественности и оберег. Вторая часть, «бай», означает «богач», «хозяин», «господин». Таким образом, имя Айдарбай можно перевести как «богатый (или знатный) обладатель айдара» или как «хозяин чуба».

Фамилия образована по стандартной для тюркских языков модели: к личному имени добавляется притяжательный аффикс («-ев» в русифицированной записи), который указывает на принадлежность к роду. Айдарбаев — буквально «из рода Айдарбая». В русскую паспортную практику фамилия вошла через ассимиляцию, поэтому сохранила окончание «-ев», типичное для русских фамилий, но не характерное для исконной тюркской словообразовательной системы, где «-баев» уже является частью имени.

Географически фамилия Айдарбаева чаще всего встречается в Казахстане, Кыргызстане, в Башкортостане и Татарстане, а также среди диаспор этих народов в России. Сравните с однокоренными фамилиями: Айдаров (от имени Айдар без второй части), Айдарханов, Айдарбеков. Все они восходят к одному корню, но различаются суффиксами и вторыми компонентами, указывая на разные ветви одного родового дерева или на разные социальные статусы предков (бай — богач, бек — князь, хан — правитель). Вероятнее всего, предок носительницы фамилии был человеком заметным — не обязательно знатным, но носившим характерное имя-прозвище по прическе, что в тюркской среде было распространенной практикой.