Фамилия Аймалеев образована по стандартной русской патронимической модели с суффиксом -ев, который в данном случае присоединился к основе Аймалей. Буквально фамилия означает «сын Аймалея» или «потомок Аймалея». Несмотря на русское оформление, корень фамилии отчетливо тюркский: она восходит к личному имени Аймалей, которое сложилось из двух частей — «ай» (луна, месяц, символ света и красоты) и «малай» (мальчик, дитя, сын). В тюркской традиции такие составные имена с «ай» были широко распространены (сравните Айдар, Айнур, Айгуль), и Аймалей — это имя-пожелание, которое можно перевести как «лунный мальчик» или «дитя месяца». Родители, называя так ребенка, желали ему светлой и счастливой судьбы или покровительства луны.

Суффикс -ев, а не тюркский родовой показатель, — ключевая подсказка о том, что фамилия оформилась в русской среде, скорее всего, у крещёных татар, башкир или других тюркских народов Поволжья и Приуралья. При переходе в православие человек получал христианское имя, но в быту и при переписях за ним могло сохраниться дохристианское родовое прозвище или имя, от которого позже и произвели фамилию по отчеству.

Лингвистическая деталь, которую часто упускают: выбор суффикса -ев, а не -ов, напрямую зависит от того, как исходное имя адаптировалось в русском языке. Имя Аймалей в русском склонялось по образцу существительных мужского рода с основой на мягкий согласный (как Алексей — Алексеев). Если бы в основе было имя Аймалай, фамилия писалась бы Аймалаев. Это чередование — обычное явление при письменной фиксации иноязычных имен в Российской империи.

Фамилия редкая. Её география ожидаемо тяготеет к регионам, где исторически жили тюркские народы: Оренбургская область, Башкортостан, Татарстан. Носители фамилии — вероятные потомки служилых татар или башкир, которые в XVIII–XIX веках, при закреплении сословного статуса и во время ревизских переписей, получали фамилии по имени отца. Сословная принадлежность могла быть разной — от государственных крестьян до казаков, но точных данных по фамилии Аймалеев нет: это область предположений, а не установленных фактов.